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2022年中国大陆食品中沙门菌耐药性特征分析  PDF

  • 田茂松 1,2
  • 黄培源 3
  • 郑蕾 3
  • 刘世伟 4
  • 贺骏 3
  • 赵柬云 2
  • 李孟寒 2
  • 彭子欣 2
  • 杨大进 2
  • 董银苹 2
  • 白莉 1,2,4
  • 吴永宁 1,2
  • 胡豫杰 2
1. 南方医科大学公共卫生学院,广东 广州 510515; 2. 国家食品安全风险评估中心 国家卫生健康委员会食品安全风险评估重点实验室,北京 100021; 3. 北京联合大学 生物化学工程学院,北京 100023; 4. 山东第二医科大学 公共卫生学院,山东 潍坊 261053

中图分类号: R155

最近更新:2025-03-19

DOI:10.13590/j.cjfh.2024.12.012

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摘要

目的

了解2022年中国大陆31个省(自治区、直辖市)食品中沙门菌分离株耐药性及黏菌素可转移耐药基因mcr的携带情况。

方法

采用微量肉汤稀释法测定575株食源性沙门菌对11类17种抗菌药物的敏感性,采用PCR检测受试菌株中mcr基因的携带情况,并对mcr基因PCR阳性菌株开展全基因组测序和生物信息学分析。

结果

575株沙门菌中耐药菌株占比84.70%(487/575),测试菌株对萘啶酸(NAL)耐药率最高,为58.61%(337/575),发现耐亚胺培南(IPM)和耐替加环素(TGC)沙门菌各1株。多重耐药率达61.39%(353/575),同时耐受抗菌药物种类最高为10类。共存在147种耐药谱,优势耐药谱为SAM-CT-AMP-NAL,占比28.57%(42/147)。不同样品来源的沙门菌耐药率差异有统计学意义,冻生鸡肉沙门菌分离株耐药率最高,为95.51%(85/89)。河北和黑龙江来源的分离株耐药率较高,均为100%。检出6株mcr-1基因阳性沙门菌,检出率为1.04%(6/575),2株来自湖北,另外4株分别来自河北、安徽、辽宁和山东的食品样品,均为多重耐药株,主要携带aac(6')-laa、mcr-1.1、fosA3等耐药基因,质粒复制子类型主要为IncI2、IncP1和IncHI2等。

结论

2022年中国大陆食品中沙门菌分离株整体耐药水平较高,多重耐药现象严重,耐药谱复杂,存在携带mcr基因的多重耐药菌株,应该引起足够重视。

沙门菌是全球具有重要公共卫生学意义的人兽共患病原菌之一,可对公众构成严重的健康危

1。世界卫生组织(World Health Organization,WHO)2018年统计数据显示,沙门菌是全球四大腹泻病病因之2,每年可造成1.53亿病例,23万人死3。欧洲食品安全局(European Food Safety Authority, EFSA)和欧洲疾病预防和控制中心(European Centre for Disease Prevention and Control,ECDC)2021年联合报告显示,沙门菌病是欧盟28个成员国中第二常见的人畜共患4。2022年美国食源性疾病主动监测网络(FoodNet)监测数据显示,经食物传播的八种病原体所引发的感染中,沙门菌感染率位列第2(每10万人16.3例5。中国约有70%~80%的细菌性食物中毒由沙门菌引起,每年约有987万例由沙门菌引起的肠胃炎病6。受污染的禽肉是引起人类感染沙门菌的主要载体,随着动物养殖过程中抗菌药物的不合理使用,沙门菌耐药性问题已日趋严重,而屠宰加工、储藏、运输、销售等环节存在的交叉污染也为耐药沙门菌沿食物链传播提供了重要渠道,对人类健康形成了潜在威7-8

质粒介导的黏菌素可转移耐药基因(mcr)能够编码磷酸乙醇胺转移酶,修饰脂质A促使细菌对黏菌素敏感性降低,介导低水平的黏菌素耐药。mcr基因可通过质粒或其他可移动元件的作用下,在同种或不同种属细菌间转移,随着LIU

9首次在动物源性大肠埃希菌中发现mcr-1,迄今为止,该基因已在世界各地的环境、动物和患者中分离的沙门菌中检测到,但我国食物来源携mcr-1基因沙门菌分离株报道较10。监测数据表明,我国食品中沙门菌分离株整体耐药水平较高,多重耐药严重,且发现携mcr-1基因的多重耐药株,其在肠杆菌科细菌中的转移传播风险不可忽11

本研究针对2022年中国大陆食品中沙门菌分离株进行抗菌药物敏感性测定,分析其耐药性特征,同时开展mcr基因PCR筛查,并针对PCR阳性株开展基因组测序和生物信息学分析,为减缓和控制食源性沙门菌耐药性的传播提供基础数据。

1 材料与方法

1.1 菌株来源

本研究所用575株沙门菌,分离自2022年国家食品污染物和有害因素风险监测网采集的食品样品。全部菌株来自我国31个省(自治区、直辖市),所有菌株均已经生化鉴定复核确认为沙门菌后入库保藏。药敏质控菌株大肠埃希菌(ATCC 25922)为本实验室保存。

1.2 主要仪器

生物安全柜(型号:AC2‑6S1,新加坡ESCO公司),恒温培养箱(型号:INCUCELL 222,德国MMM公司),台式离心机(型号:1‑14,美国SIGMA公司),PCR仪(C1000Touch)、电泳仪(POWERPA BASIC)和凝胶成像系统(Universal Hood Ⅱ)均购自美国伯乐(Bio‑Rad)公司,DensiCHEK Plus比浊仪、Vitek2 Compact生化鉴定仪均购自法国Biomerieux公司。

1.3 主要试剂

脑心浸液琼脂(Brain heart agar,BHA)和脑心浸液肉汤(Brain heart infusion,BHI)购自北京陆桥公司,PCR MasterMix、100 bp DNA Ladder、DNA提取试剂盒均购自天根生化科技(北京)有限公司。抗菌药物药敏板及药敏肉汤均购自复星诊断科技(上海)有限公司,包括以下11类17种抗菌药物:萘啶酸(Nalidixic acid,NAL)、环丙沙星(Ciprofloxacin,CIP)、氨苄西林(Ampicillin,AMP)、氨苄西林/舒巴坦(Ampicillin-sulbactam,SAM)、四环素(Tetracycline,TET)、氯霉素(Chloramphenicol,CHL)、氟苯尼考(Florfenicol,FFC)、复方新诺明(Trimethoprim‑sulfamethoxazole,SXT)、头孢噻肟(Cefotaxime,CTX)、头孢他啶(Ceftazidime,CAZ)、庆大霉素(Gentamicin,GEN)、亚胺培南(Imipenem,IPM)、多黏菌素E(Colistin,CT)、阿奇霉素(Azithromycin,AZI)、替加环素(Tigecycline,TGC)、头孢唑啉(Cefazolin,CFZ)、头孢西丁(Cefoxitin,FOX)。

1.4 药物敏感性测试

使用微量肉汤稀释法对分离到的沙门菌进行耐药性实验。待测菌株用一次性无菌接种环,从冻存管划线接种至BHA平板37 ℃过夜培养复苏,挑取单颗菌落再次转接BHA平板37 ℃培养24 h,使用0.85%生理盐水制作0.5麦氏浊度单位菌悬液,取60 μL菌悬液至含有12 mL药敏接种培养液的“V”形加样槽中,充分混匀后,用8通道微量移液器按照100 μL/孔加至药敏板,置于恒温恒湿培养箱内37 ℃孵育18~24 h,大肠埃希菌(ATCC 25922)为质控菌株,肉眼读取抑制受试菌株生长的最小浓度孔(Minimum inhibitory concentration,MIC)。依据2022版美国临床和实验室标准化协会(CLSI,M100-S32,2022)发布的药物敏感性及耐药标

12,对受试菌株敏感(S)、中介(I)和耐药(R)进行判定。FFC(MIC≥16 μg/mL)和TGC(MIC≥1 μg/mL)的耐药判定分别参照CLSI动物源性细菌药敏试验操作标13和欧洲抗菌药物敏感试验委员会(EUCAST)相关标14

1.5 mcr基因检测

水煮法提取受试菌株基因组DNA,采用PCR方法检测mcr基因,扩增方法和条件参照文献[

15-16]。阳性对照样品为本实验室保存的2015年沙门菌食品分离株2015S109617,已经全基因组测序确认携带mcr-1基因。引物信息见表1

表1  PCR检测mcr所用引物信息
Table 1  Primers used for PCR detection of mcr genes
目的基因引物名称引物序列(5’-3’)片段大小(bp)
mcr-1 mcr-1_F AGTCCGTTTGTTCTTGTGGC 320
mcr-1_R AGATCCTTGGTCTCGGCTTG
mcr-2 mcr-2_F TCTAGCCCGACAAGCATACC 715
mcr-2_R TCTAGCCCGACAAGCATACC
mcr-3 mcr-3_F AAATAAAAATTGTTCCGCTTATG 929
mcr-3_R AATGGAGATCCCCGTTTTT
mcr-4 mcr-4_F TCACTTTCATCACTGCGTTG 1 116
mcr-4_R TTGGTCCATGACTACCAATG
mcr-5 mcr-5_F ATGCGGTTGTCTGCATTTATC 1 644
mcr-5_R TCATTGTGGTTGTCCTTTTCTG
mcr-6 mcr-6_F AGCTATGTCAATCCCGTGAT' 252
mcr-6_R ATTGGCTAGGTTGTCAATC
mcr-7 mcr-7_F GCCCTTCTTTTCGTTGTT 551
mcr-7_R GGTTGGTCTCTTTCTCGT
mcr-8 mcr-8_F TCAACAATTCTACAAAGCGTG 856
mcr-8_R AATGCTGCGCGAATGAAG
mcr-9 mcr-9_F TTCCCTTTGTTCTGGTTG 1 011
mcr-9_R GCAGGTAATAAGTCGGTC

1.6 全基因组测序和生物信息学分析

针对PCR筛选出的mcr基因阳性沙门菌株,BHA平板挑取单菌落传二代,用商品化试剂盒法提基因组DNA,送至上海美吉生物医药科技有限公司进行全基因组测序(Illumina NovaSeq PE150),并通过生物信息学分析对PCR扩增阳性结果进行mcr基因确证。使用SeqSero2软件(v1.2.1 2021.05.23)进行沙门菌血清型预测,使用Center for Genomic Epidemiology(CGE)网站基因组开放预测平台,按照默认质量和阈值参数,通过ResFinder 4.4.3、PlasmidFinder 2.1和MLST 2.0预测耐药基因、质粒复制子类型和ST型(https://cge.food.dtu.dk/services/)。

1.7 统计学分析

利用Excel 2016和OriginPro 2021进行数据统计和图表制作,使用SPSS 25.0软件对耐药率进行Pearson χ2检验,以P<0.05为差异有统计学意义。

2 结果

2.1 沙门菌分离株对17种抗菌药物的耐药结果

575株沙门菌中有487株(84.70%)为耐药菌株,对受试的17种抗菌药物呈现不同程度的耐药性。其中,对NAL耐药率最高,为58.61%(337/575),其次为AMP、TET、SAM、FFC分别为57.57%(331/575)、49.22%(283/575)、47.30%(272/575)和40.52%(233/575);CHL、CFZ、CT、SXT、CTX和GEN的耐药率在20%~40%之间,分别为40.00%(230/575)、32.70%(188/575)、30.43%(175/575)、27.65%(159/575)、24.70%(142/575)和23.30%(134/575);对AZI、CIP、CAZ的耐药率在10%~20%之间;对FOX耐药率为1.74%(10/575),对IPM和TGC耐药率低于1%,均为0.17%(1/575);对CFZ、FFC、FOX、SAM、CIP中介率超过4%,分别为18.61%(107/575)、15.48%(89/575)、10.96%(63/575)、9.91%(57/575)和4.87%(28/575)。检出耐IPM和耐TGC沙门菌各1株,分别来自河北的鸡肉和四川的食品样品。详见表2

表2  575株沙门菌对17种抗菌药物敏感性测试结果
Table 2  Antimicrobial susceptibility testing results for 575 Salmonella isolates against 17 antimicrobials
抗菌药物类别抗菌药物简称耐药菌株数/%中介菌株数/%敏感菌株数/%
内酰胺/内酰胺酶抑制剂类 SAM 272(47.30) 57(9.91) 246(42.78)
碳青霉烯类 IPM 1(0.17) 0(0) 574(99.83)
氨基糖苷类 GEN 134(23.30) 9(1.57) 432(75.13)
大环内酯类 AZI 67(11.65) 508(88.35)
四环素类 TET 283(49.22) 1(0.17) 291(50.61)
TGC 1(0.17) 574(99.83)
苯丙醇类 CHL 230(40.00) 8(1.39) 337(58.61)
FFC 233(40.52) 89(15.48) 253(44.00)
多黏菌素类 CT 175(30.43) 400(69.57)
青霉素类 AMP 331(57.57) 0(0) 244(42.43)
喹诺酮类 NAL 337(58.61) 238(41.39)
CIP 107(18.61) 28(4.87) 440(76.52)
头孢类 CAZ 96(16.70) 16(2.78) 463(80.52)
FOX 10(1.74) 63(10.96) 502(87.30)
CTX 142(24.70) 0(0) 433(75.30)
CFZ 188(32.70) 107(18.61) 280(48.70)
磺胺类 SXT 159(27.65) 416(72.35)

注:  “—”表示CLSI或EUCAST标准中没有相关判定标准

2.2 耐药谱分布情况

多重耐药(MDR)菌株共有353株,占所有菌株的61.39%(353/575)。耐受2类抗菌药物的菌株数量最多(14.43%,83/575),其次为同时耐受5类抗菌药物的菌株(13.04%,75/575)和同时耐受4类抗菌药物的菌株(12.00%,69/575),受试沙门菌同时耐受抗菌药物种类最高为10类。487株耐药沙门菌共有147种耐药谱,多重耐药(同时耐受3类及3类以上药物)沙门菌中优势耐药谱为SAM-CT-AMP-NAL(42株)。检出4株同时耐受10类抗菌药物的沙门菌,其中有2株可同时耐受除碳青霉烯类以外的10类14种抗菌药物,1株可同时耐受除碳青霉烯类以外的10类15种抗菌药物,1株可同时耐受除多黏菌素类以外的10类15种抗菌药物。受试菌株耐受抗菌药物种类情况见图1

图1  沙门菌耐受药物种类及其占比(n=575)

Figure 1  Types and proportion of Salmonella resistant to 10 classes of 17 antimicrobials (n=575)

注:  R0~R10表示沙门菌分离株同时耐受所测试10类抗菌药物的种类数

2.3 不同地区和食品来源沙门菌分离株耐药结果

不同地区沙门菌耐药结果显示,河北、黑龙江和河南分离株耐药率在90%以上,分别为100.00%(23/23)、100.00%(22/22)和93.18%(41/44),广东、山东、四川、陕西、内蒙古、云南、湖南和江苏等地分离株耐药率在80%~90%之间,分别为:88.24%(30/34)、84.62%(22/26)、84.44%(38/45)、84.38%(27/32)、84.00%(21/25)、84.00%(21/25)、80.33%(49/61)和80.00%(16/20),不同地区沙门菌分离株耐药率间差异具有统计学意义(P=0.023)。河北分离株多重耐药率高达82.61%(19/23),其次为河南77.27%(34/44)、陕西75.00%(24/32)、内蒙古72.00%(18/25)、山东69.23%(18/26)、四川68.89%(31/45)和广东64.71%(22/34),其他省(自治区、直辖市)多重耐药率介于42%~57%之间。湖北、陕西、山东和江西的七重及以上耐药菌株比例超过30%。全国各地区沙门菌分离株的多重耐药率情况详见图2

图2  不同地区来源沙门菌多重耐药状况

Figure 2  Multi-drug resistance of Salmonella isolates from different provinces

注:  “其他”地区包括山西、安徽、湖北、江西、北京、重庆、吉林、甘肃、辽宁、福建、海南、贵州、新疆生产建设兵团、宁夏、上海、天津、新疆、青海等省(自治区、直辖市),实验菌株数目少于20株,不参与单独省份的耐药率评价,耐药率为84.81%(134/158)

将所有沙门菌分离株的不同食品样品来源分为7类,耐药率结果显示,冻生鸡肉、冷却生鸡肉和调理鸡肉分离出来的沙门菌耐药率在90%以上,分别为95.51%(85/89)、92.31%(36/39)和92%(46/50),其次为其他生禽肉和鲜鸡肉的沙门菌分离株耐药率在80%~90%之间,分别为85.29%(58/68)和83.98%(152/181),不同样品来源的沙门菌耐药率不同,差异具有统计学意义(P<0.001)。多重耐药率在42%~78%之间,其他食品样品来源(即非禽类食品)沙门菌分离株多重耐药率最低为42.11%(24/57),调理鸡肉样品来源沙门菌分离株多重耐药率最高为78.00%(39/50)。详见图3

图3  不同样品来源沙门菌多重耐药状况

Figure 3  Multi-drug resistance of Salmonella isolates from different sample sources

注:  “其他食品”种类包括调味品、蔬菜及其制品、食用菌

2.4 mcr基因检测结果

普通PCR检测结果表明,575株沙门菌分离株中有6株mcr-1基因PCR阳性,未检出mcr-2~mcr-9基因,mcr-1基因PCR阳性率为1.04%,其中2株为来自湖北的食品样品(具体未知),4株为来自河北、安徽和山东的冻生鸡肉样品以及辽宁的调理鸡肉样品。6株mcr-1阳性沙门菌均具有七重及以上耐药谱。

2.5 全基因组测序结果和生信分析

WGS数据显示,6株mcr-1基因PCR阳性菌株中,3株为印第安纳(Indiana)沙门菌,2株为胥伐成格隆(Schwarzengrund)沙门菌,1株为肯塔基(Kentucky)沙门菌;3株印第安纳沙门菌均为ST17型,2株胥伐成格隆沙门菌为ST241型,肯塔基沙门菌为ST198型。6株菌株的mcr-1基因均为mcr-1.1型别。耐药基因分析表明6株菌株携带耐药基因数目在11~25种之间,主要携带mcr-1.1、aac(6')-laa、fosA3、tet(A) 等耐药基因,质粒复制子类型主要为IncI2、IncP1和IncHI2等,不同菌株携带的耐药基因和质粒复制子类型均有差别。详见表4。

表3  6株mcr基因PCR阳性菌株部分表型和基因型
Table 3  Information of 6 mcr gene PCR positive strains in this study
菌株编号血清型ST型多重耐药数耐药谱耐药基因质粒复制子类型
2022S60 Indiana 17 10 SAM-GEN-AZI-TET-CHL-FFC-CT-AMP-NAL-CAZ-CIP-CTX-CFZ-SXT aac(3)-Iv、aac(6')-Ib-cr、aac(6')-laa、aadA22、aadA5、aph(3')-Ia、aph(3')-Ib、aph(4)-Ia、aph(6)-Id、armA、ARR-3、blaCTX-M-55、blaOXA-1、bleO、catB3、dfrA17、fosA3、lnu(F)、mcr-1.1、mph(A)、mph(E)、msr(E)、oqxA、oqxB、sul2、tet(A) IncP1
2022S75 Indiana 17 10 SAM-GEN-AZI-TET-CHL-FFC-CT-AMP-NAL-CAZ-CIP-CTX-CFZ-SXT aac(3)-Iv、aac(6')-Ib-cr、aac(6')-laa、aadA5、aph(3')-IIa、aph(4)-Ia、armA、ARR-3、blaCTX-M-65、blaOXA-1、catB3、dfrA17、floR、fosA3、mcr-1.1、mph(A)、sul1、sul2、tet(A) Col156、IncHI2、IncHI2A、IncX1
2022S1970 Indiana 17 10 SAM-GEN-AZI-TET-CHL-FFC-CT-AMP-NAL-CAZ-CIP-CTX-CFZ-SXT aac(6')-laa、aac(3)-Iv、aac(6')-Ib-cr、aph(4)-Ia、ARR-3、blaCTX-M-123、blaOXA-1、catB3、dfrA12、floR、fosA3、mcr-1.1、mph(A)、sul1、sul2、tet(A) Col440Ⅱ、IncI(Gamma)、IncP1
2022S175 Schwarzengrund 241 7 SAM-TET-CT-AMP-NAL-CIP-CTX-CFZ-SXT aac(6')-laa、aac(6')-Ib-cr、aadA2、aph(3')-Ia、ARR-3、blaCTX-M-65、blaOXA-1、catB3、dfrA12、fosA3、mcr-1.1、oqxA、oqxB、qnrS1、sul1、sul3、tet(A) IncHI2、IncHI2A、IncI2(Delta)、IncR
2022S1610 Schwarzengrund 241 7 SAM-TET-CT-AMP-NAL-CTX-CFZ-SXT aac(6')-laa、aadA2、blaCTX-M-14、bleO、dfrA12、fosA3、mcr-1.1、qnrS1、sul1、sul3、tet(A) IncHI2、IncHI2A
2022S2230 Kentucky 198 7 SAM-GEN-CHL-FFC-CT-AMP-NAL-CAZ-CIP-CTX-CFZ aac(6')-laa、aac(3)-IId、aac(3)-Iv、aph(3')-Ia、aph(4)-Ia、blaCTX-M-55、blaTEM-1B、blaTEM-141、blaTEM-206、blaTEM-209、blaTEM-214、floR、fosA3、mcr-1.1、rmtB IncI2(Delta)

3 讨论

本研究结果显示,2022年我国食品中分离的沙门菌整体耐药率(84.70%)和多重耐药率(61.39%)均较高,其中耐药率最高的四种药物分别为NAL、AMP、TET和SAM,与2015、2016和2020年我国食品中沙门菌耐药情

17-19相符,提示这4种抗菌药物可能在我国食品链条中存在长期、不规范使用的情况。头孢类和氟喹诺酮类抗菌药物是目前临床治疗沙门菌感染的一线药物,在全球范围内得到了广泛应20-21。本研究表明近年来我国食源性沙门菌对临床沙门菌感染治疗的这两类一线抗菌药物的耐药性处于较高水平,这将一定程度增加我国临床沙门菌病感染治疗的压力,提示相关部门应持续加强食品中沙门菌耐药性的监测工作,为临床治疗沙门菌感染的药物选择和使用提供科学支持。本研究中多重耐药菌株比例超过60%,对至少7类抗菌药物同时耐药的菌株比例接近20%,且存在可同时耐受10类15种抗菌药物的菌株沙门菌,表现出严重的耐药性,且耐药谱数目近150种,菌株耐药模式趋于复杂多样化。

本研究结果显示,2022年我国食源性沙门菌耐药性存在一定程度的地区差异性,部分地区多重耐药情况较严重,如河北、河南和陕西,与以往研究结果一

22-24。值得注意的是,四川食品样品中检出1株耐替加环素沙门菌,而该药物禁止在动物生产中使用,后续研究将继续针对该菌株在食品生产过程中的可能污染来源、替加环素耐药基因的获得途径及进化方式进行进一步研究。已有研究表明,四环素类药物耐药基因tet(X)及其变体可通过质粒等可移动遗传元件在不同细菌之间水平转移,这将会导致更多耐TGC菌株的产25-26。分析原因可能是该类抗菌药物价格较低,使用年限长,且该类抗菌药物在禽畜类动物养殖过程中存在滥用的情况,这导致了禽畜类动物养殖环境中沙门菌对四环素类药物耐药性不断攀升,而该类食物又是沙门菌常见的污染载体,这些条件结合起来在一定程度上加速了此类多重耐药菌的产生。因此,我们应该严格遵循《遏制细菌耐药国家行动计划(2016—2020年)》等一系列政策措施,控制抗菌药物在禽畜类动物中的使用,减少对抗菌药物的依赖性。此前我国山东青岛曾报道在肉鸡样本中分离出携blaNDM-1基因、对碳青霉烯类药物耐药的沙门27,本研究中河北1份鸡翅根样品中检出了1株可对IPM耐药的10重耐药菌株,提示我国禽类食品的养殖、屠宰加工、流通、销售等食品生产链条中沙门菌分离株中可能已经出现了可移动碳青霉烯酶耐药基因的流行和传播,亟需对这两类药物在食源性沙门菌中的耐药性特征进行重点监测,同时进一步开展耐药机制和传播机制的研究。

多黏菌素在2018年已经被禁止用于动物生长促进剂

28,但本研究结果显示我国食源性沙门菌对CT耐药率仍保持在较高水平(30.43%),一方面提示我国还应继续加强动物养殖环节生长促进剂的监管,另一方面需要对多黏菌素类药物耐药机制的传播进行进一步研究。最新研究显示,mcr基因已通过IncI2、IncX4和IncHI2等流行性质粒以及可移动元件在全球不同国家和地区的人、动物、食品和环境源多种肠杆科细菌中广泛传29-30,本研究mcr基因阳性沙门菌检出率(1.04%)虽然处于较低水平,但高于LYU312017年在北京地区零售生肉来源(0.88%,3/341)和HU322011—2016年中国不同食品来源(0.27%,7/2558)沙门菌中mcr基因阳性率,提示mcr阳性沙门菌在我国“动物-食品-人”传播链中可能仍然保持较高的本底,在当前农业部门在动物养殖环节限制黏菌素使用的情况下该基因仍能保持较高的传播水平,应当引起人们高度重视。值得一提的是,有研究指出ST17型印第安纳沙门菌已经广泛传播,并且能够获得对临床多种重要抗菌药物的耐药性33-34,而本研究中6株mcr阳性沙门菌中有3株为印第安纳沙门菌ST17型且同样表现出高水平耐药性,提示沙门菌的耐药状况可能与其血清型或ST型存在一定关联。此外,与SUN35对中国108株印第安纳沙门菌ST17的系统发育分析结果相似,本研究结果也提示ST17型印第安纳沙门菌可能是mcr-1的潜在流行载体。从携带的耐药基因数量和种类上来看,这6株mcr阳性菌株均携带了不同类型的耐药基因,与其对应的耐药表型基本符合,质粒复制子类型主要为IncI2、IncP1和IncHI2,这与欧洲地区流行趋势基本一36,但与美国和非洲流行情况有差37-38。有研究表明,IncHI2可参与β-内酰胺酶耐药基因和喹诺酮类耐药基因的广泛传播,能够使菌株对该类抗菌药物敏感性急速下39,提示在后续研究中,应适当关注不同质粒所携带的可移动遗传元件情况,这将有助于了解抗菌药物耐药性的来源和传播。虽然本研究的mcr阳性沙门菌检出率整体上较低,但其介导的黏菌素耐药能够在不同细菌之间进行传播和转移,而IncHI2等质粒还能携带其他耐药基因,这将会导致更多、更复杂耐药基因的出现和扩散,对其他菌群的耐药传递产生潜在威胁。考虑到本研究中针对替加环素和碳青霉烯类药物均检出耐药菌株,提示多黏菌素类药物作为对抗耐多药革兰氏阴性杆菌感染的“最后一道防线”可能存在潜在破防风险,因此,一方面应该继续加强农业和临床缓解抗菌药物尤其是多黏菌素类药物的监管,另一方面需要对不同环节食源性沙门菌黏菌素耐药性及可移动遗传元件进行持续监测,并对耐药机制和传播机制开展进一步研究,以掌握和评估mcr基因在我国的传播路径与播散特点。

综上所述,2022年中国大陆食源性沙门菌耐药水平较高,多重耐药较严重,耐药谱复杂多样化,检出对几种临床上治疗多重耐药沙门菌感染的重要药物的耐药株,且部分菌株携带mcr-1基因,应引起相关部门高度重视。同时,需要结合重要耐药基因特征、血清型分析,对食源性沙门菌进行持续性耐药监测工作,对检出的携带mcr等介导重要可移动耐药基因机制的菌株开展核苷酸序列比对和溯源分析,为政府风险决策、更高效地对沙门菌分离株进行溯源分析,更合理地为临床用药提供科学依据,最终切实保障我国食品安全。

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