为监测粮食中的串珠镰刀菌污染，根据rDNA18S、5．8S、28S及其间区ITS和ITS2序列，设计了1对镰刀菌属特异性引物Fu3／Fu4及2对串珠镰刀菌种特异性引物Fu5／Fu4(Ⅰ型ITS2特异性)和Fu3／Fu2(Ⅱ型ITS2特异性)，建立了串珠镰刀菌PCR及复合PCR检测方法。Fu3／Fu4、Fu3/Fu2和FuS／Fu4分剐扩增516bp、375bp和188bp的DNA片段。Fu3／Fu4 PCR的检出灵敏度为10pg，FuS／Fu4为100pg，复合PCR(Fu3、Fu5和Fu4)的检出限为100pg，分别相当于每次反应检出10^3、10^4和10^4个孢子。复合PCR可以同时鉴别镰刀菌属和串珠镰刀菌种。检测了32株从山东、浙江、安徽和河南4省区分离的串珠镰刀菌及交孢镰刀菌，26株为Ⅰ型ITS2特异性，4株为Ⅱ型ITS2特异性，两株待定。该方法可用于大量快速筛选串珠镰刀菌，有利于进一步开展串珠镰刀茵在我国的生态分布、生物地域学及系统发育学等方面的研究。该方法快速、敏感、特异，适宜粮食中串珠镰刀菌污染的监测。